Llegó en 2016 procedente del Atlético de Madrid y, desde entonces,  João Miranda se ha convertido en un imprescindible en la defensa del Inter, jugando más de 30 partidos por temporada. Según apunta Calciomercato, el club de Milán estaría cerca de renovar al central brasileño hasta 2020 (su vinculación ahora es hasta 2019).